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镍元素对不锈钢的影响(A)


更新时间:2019-10-05  


  真核生物绝大多数mRNA前体都需要经过3末端的核苷酸信号识别、切割、添加一段腺苷酸尾巴,这个过程称为多聚腺苷化(polyadenylation, poly(A))【1】。近年的研究发现大概50%的基因具有多个poly(A)位点,称之为选择性腺苷化(Alternative PolyAdenylation, APA)【2,3】。不同poly(A)位点的选择使得一个基因产生多种转录本,从而增加了转录本的多样性,因此,APA是存在于真核生物中一种重要的基因表达调控机制,其关键步骤是mRNA前体的核苷酸序列的识别,直接决定了成熟mRNA转录本的序列【4】。然而,植物中poly(A)信号识别的机制还知之甚少,原先认为是开花因子的FY在全基因组范围内参与多聚腺苷化过程的分子机制还未见报道。

  李庆顺团队使用一系列FY突变体及FY/AtCPSF30双突变体,结合该团队研发的3末端高通量测序方法PolyA标签测序法(PAT-seq),全面探讨了FY不同结构域在poly(A)位点使用中的作用,同时阐明FY与AtCPSF30在poly(A)信号识别过程中的关系。结果表明,FY的WD40结构域的突变比PPLPP结构域缺失对poly(A)位点使用有着更强的影响(图1)。

  研究发现,FY的WD40结构域的突变与PPLPP结构域的缺失对3UTR的poly(A)位点选择和信号使用有着相反的影响(图2)。此外,FY与AtCPSF30在信号识别中的功能并不是完全重叠,但都参与了A-rich信号的识别(图2)。进一步证明了FY和AtCPSF30调控的APA参与开花时间、主根生长和非生物胁迫反应过程的调控。

  图2. 3UTR区间NUE信号区的单核苷酸使用以及信号分析。(A-G)单核苷酸使用,“oxt6 unique”代表oxt6特异的poly(A)位点,相对于野生型,只有oxt6有此位点。“WT unique”代表WT特异的poly(A)位点。“Common”代表同时存在于野生型和突变体中的poly(A)位点,其他突变体有着相似的表示方式。(H)和(I)保守的AAUAAA信号和其一个碱基变异的信号使用分析。“WT-oxt6”相对于oxt6,野生型中特异的poly(A)位点,才订的婚房卫生间对着入户门有什么讲究吗听说风水不好有破解办法,其他突变体有着相似的表示方式。

  厦门大学环境与生态学院的李庆顺教授为该论文的通讯作者,博士生于志波为论文第一作者,博士后林俊城参与研究。